Thèmes de recherche
Ecologie microbienne des communautés bactériennes et fongiques dans l’environnement (plantes, sol, …)PhytopathologieLutte biologiqueMots-clés
Microbial Ecology: fungi and bacteria, Microbiology, Molecular Biology, Metagenomics, Metabarcoding - BioinformaticsBio
Jessica Vallance, docteur en Ecologie Microbienne de l’Université de Brest, a été recrutée en tant qu’Ingénieur de Recherche à Bordeaux Sciences Agro en 2012. Ses travaux de thèse portaient sur l’agent de lutte biologique Pythium oligandrum : colonisation de la rhizosphère et influence sur la dynamique des populations microbiennes. Actuellement, ses activités de recherche sont centrées sur la mise en place et le développement de techniques de métagénomique pour l’étude et la caractérisation des communautés microbiennes associées à deux agro-écosystèmes, vigne et forêt, dans un but de production et protection optimales des plantes.
Publications
2026
- Differential Impacts of Drought and Esca Expression on Ascomycota Fungi in the Trunks and Young Organs of Mature Grapevines — , Phytobiomes Journal, 2026 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1094/PBIOMES-07-25-0048-R
- Developing a culturomic approach to build a collection of grapevine foliar microorganisms with potential applications in disease biocontrol — , OENO One, 2026 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.20870/oeno-one.2026.60.1.9588
2025
- Action of Pythium oligandrum on Grapevine Trunk Diseases and its impact on microbial communities — , Biological Control, 2025 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.biocontrol.2025.105779
- Mining belowground and aboveground microbiome data to identify microbial biomarkers of grapevine health and yield — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
- Action of Pythium oligandrum on Grapevine Trunk Diseases and its impact on microbial communities — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
- Developing a microfluidic qPCR chip to quantify microbial taxa with a potential biocontrol activity against grapevine downy mildew — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
- Mining belowground and aboveground microbiome data to identify microbial biomarkers of grapevine health and yield — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
- Biocontrol of grapevine downy mildew: A Synthetic Microbial Community (SynCom) approach — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
- Apport des recherches sur le microbiote aux futures stratégies de biocontrôle - Résultats du projet VITAE — , 2025 (Communication). Lire sur HAL
2024
- Grapevine pruning strategy affects trunk disease symptoms, wood pathobiome and mycobiome — , Phytopathologia Mediterranea, 2024 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.36253/phyto-14778
- Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola) — , 2024 (Communication). Lire sur HAL
- Gérer le microbiote de la vigne pour réduire l’utilisation des pesticides - Synthèse des résultats du WP1 du projet VITAE et perspectives — , 2024 (Communication). Lire sur HAL
- Exploitation des données du microbiote pour identifier les antagonistes du mildiou de la vigne (Plasmopara viticola) — , 2024 (Communication). Lire sur HAL
- Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola) — , 2024 (Communication). Lire sur HAL
- Developing a culturomic approach to build a collection of grapevine foliar microorganisms with potential biocontrol activity against downy mildew — , 2024. Lire sur HAL
2023
- Single and combined effects of Pythium oligandrum Po37 and a consortium of three rhizobacterial strains on Sclerotinia stem rot severity and tomato growth promotion — , Journal of Plant Pathology, 2023 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1007/s42161-022-01241-9
- Towards microbiota-based disease management: analysis of grapevine microbiota in plots with contrasted levels of downy mildew infection — , 2023 (Communication). Lire sur HAL
- Recherche de bioindicateurs microbiens de la résilience de la vigne en Champagne — , 2023 (Communication). Lire sur HAL
- Towards microbiota-based disease management: analysis of grapevine microbiota in plots with contrasted levels of downy mildew infection — , 2023. Lire sur HAL
2022
- Exploring the Temporal Dynamics of the Fungal Microbiome in Rootstocks, the Lesser-Known Half of the Grapevine Crop — , Journal of Fungi, 2022 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.3390/jof8050421
2021
- Bacteria associated with wood tissues of Esca‐diseased grapevines: functional diversity and synergy with Fomitiporia mediterranea to degrade wood components — , Environmental Microbiology, 2021 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1111/1462-2920.15676
- Combining potential oomycete and bacterial biocontrol agents as a tool to fight tomato Rhizoctonia root rot — , Biological Control, 2021 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.biocontrol.2020.104521
- Microbial networks inferred from environmental DNA data for biomonitoring ecosystem change: strengths and pitfalls — , Molecular Ecology Resources, 2021 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1111/1755-0998.13302
- Microbial association networks give relevant insights into plant pathobiomes — , 2021. Lire sur HAL DOI : 10.1101/2020.02.21.958033
2020
- Major changes in grapevine wood microbiota are associated with the onset of esca, a devastating trunk disease — , Environmental Microbiology, 2020 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1111/1462-2920.15180
2019
- Bioinformatics matters: The accuracy of plant and soil fungal community data is highly dependent on the metabarcoding pipeline — , Fungal Ecology, 2019 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.funeco.2019.03.005
- Isolation, identification and in vitro characterization of grapevine rhizobacteria to control ochratoxigenic Aspergillus spp. on grapes — , Biological Control, 2019 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.biocontrol.2018.10.019
- Ecophysiological impacts of Esca, a devastating grapevine trunk disease, on Vitis vinifera L. — , PLoS ONE, 2019 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1371/journal.pone.0222586
2018
- Study of Lasidiodiplodia pseudotheobromae, Neofusicoccum parvum and Schizophyllum commune, three pathogenic fungi associated with the Grapevine Trunk Diseases in the North of Tunisia — , European Journal of Plant Pathology, 2018 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1007/s10658-018-1458-z
- Bacterial shifts in nutrient solutions flowing through biofilters used in tomato soilless culture — , Microbial ecology, 2018 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1007/s00248-017-1117-5
- L’enseignent supérieur agricole bordelais an appui à la transition agroécologique — , Union Girondine des Vins de Bordeaux, 2018 (Article scientifique). Lire sur HAL
- L’enseignement supérieur agricole bordelais fortement impliqué dans la transition agro-écologique à travers les actions menées sur son domaine viticole Luchey-Halde — , Union Girondine des Vins de Bordeaux, 2018 (Article scientifique). Lire sur HAL
- Influence of landscape structure and cropping system on microbial diversity and microbial interactions in vineyards — , 2018 (Communication). Lire sur HAL
- Its all fun guys: a comparison of bioinformatic pipelines for metabarcoding plant and soil fungal communities — , 2018. Lire sur HAL
2017
- Nickel drives bacterial community diversity in the rhizosphere of the hyperaccumulator Alyssum murale — , Soil Biology and Biochemistry, 2017 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.soilbio.2017.07.010
- Biocontrôle de Neofusicoccum parvum, un agent pathogène impliqué dans les maladies du bois de la vigne, par deux bactéries isolées de cépages français et tunisien — , 2017 (Communication). Lire sur HAL
2016
- Learning ecological networks from next-generation sequencing data — , 2016 (Chapitres d’ouvrage). Lire sur HAL DOI : 10.1016/bs.aecr.2015.10.004
- Characterization of tomato-associated rhizobacteria recovered from various tomato-growing sites in Tunisia — , Journal of Plant Pathology and Microbiology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.4172/2157-7471.1000351
- Phyllosphere fungal communities differentiate more thoroughly than bacterial communities along an elevation gradient — , Microbial ecology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1007/s00248-016-0742-8
- Comparative efficacy of three tomato-associated rhizobacteria used singly or in combination in suppressing rhizoctonia root rot and enhancing tomato growth — , Journal of Microbial & Biochemical Technology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.4172/1948-5948.1000272
- Bio-suppression of sclerotinia stem rot of tomato and biostimulation of plant growth using tomato-associated rhizobacteria — , Journal of Plant Pathology and Microbiology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.4172/2157-7471.1000331
- Biocontrol of rhizoctonia root rot in tomato and enhancement of plant growth using rhizobacteria naturally associated to tomato — , Journal of Plant Pathology and Microbiology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.4172/2157-7471.1000356
- Endophytic bacteria with antagonistic traits inhabit the wood tissues of grapevines from Tunisian vineyards — , Biological Control, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1016/j.biocontrol.2016.04.005
- Evaluation of the effectiveness of tomato-associated rhizobacteria applied singly or as three-strain consortium for biosuppression of Sclerotinia stem rot in tomato — , Journal of Microbial & Biochemical Technology, 2016 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.4172/1948-5948.1000302
- Nickel drives the bacterial community diversity in the rhizosphere of the hyperaccumulator Alyssum murale — , 2016. Lire sur HAL
2015
- Phytoextraction of nickel and rhizosphere microbial communities under mono- or multispecies hyperaccumulator plant cover in a serpentine soil — , Australian Journal of Botany, 2015 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.1071/BT14249
- Bacteria in a wood fungal disease: characterization of bacterial communities in wood tissues of esca-foliar symptomatic and asymptomatic grapevines — , Frontiers in Microbiology, 2015 (Article scientifique). Lire sur HAL DOI : 10.3389/fmicb.2015.01137
- Biocontrôle d’une maladie du bois de la vigne, l’esca à l’aide de bactéries — , 2015 (Communication). Lire sur HAL
- Maladies du bois en Tunisie: communautés fongiques et utilisation d’huiles essentielles comme moyen de lutte — , 2015 (Communication). Lire sur HAL
- Monitoring microbial networks: current challenges — , 2015 (Communication). Lire sur HAL
Unités de recherche et labos
UMR 1065 SAVE
Research on Grapevine Trunk Diseases